[Continium]

А ведь основная тема Гражданки это свобода воли и несение ответственности за свои действия.

Ещё немного спойлеров

Ратификация отнимает свободу воли у Авенджеров, что перекликается с тем что Баки, когда убивал под заложенной программой, тоже действовал не по своей воле.
И в конце таки Баки отказывается быть вновь заюзаным без его согласия и ложиться в заморозку. Опять же, желание иметь свободу воли, а не подчиняясь приказам творить разрушительную фигню, после чего спокойно говорить "А это не я, меня послали".
Стив солдат, как и Баки, и он уже напробовался и дурацких приказов и подстав от начальства. Посему он понимает чем грозит ратификация. И если уж жертвы неизбежны, то он хочет иметь возможность сказать "Да, это моя вина", принять на себя ответственность и по возможности ответить за свои поступки. Да, к жизни он уже никого не сможет вернуть, и если он сядет в тюрьму толку будет мало, но вот встать, заслонив человечество собой, дабы пострадали не миллиарды, а сотни, а может даже десятки, он в следующий раз сможет. И будет делать это раз за разом, не потому что приказали, а по зову натуры.
Поведение Наташи и Т'Чаллы прекрасно иллюстрирует тему свободной воли и выбора быть самому ответственным за свои действия.
И если кто-то не понимает почему Баки попросил его заморозить, а не продолжил геройствовать рядом со Стивом, то эти не слишком внимательно смотрели фильм, или смотрели его через призму шипперства.